Practical course of confocal microscopy: multiple fluorescent labeling, deconvolution, co-localization, 3D reconstruction

Syllabus

viz kurz z roku 2007 http://udmp.lf1.cuni.cz/web2/facility/microscope/course.htm

Annotation

Praktický kurz konfokální mikroskopie: vícečetné fluorescenční značení, dekonvoluce, kolokalizace, 3D rekonstrukce.

Jedná se o praktický kurz zaměřený na současné techniky buněčné biologie v oblasti optické mikroskopie s těžištěm v konfokální mikroskopii, restoraci a analýze obrazu. Kurz je určen pro vysoce motivované studenty magisterského studia přírodních oborů, kteří uvažují o Ph.D. studiu a dále pro postgraduální studenty v oborech, kde lze očekávat využití těchto technik. Výuka bude probíhat v českém jazyce ve skupině max. osmi studentů formou tří po sobě jdoucích teoreticko-praktických cvičení. Každé ze cvičení bude probíhat v rozsahu 4-6 hodin v odpoledních hodinách s využitím mikroskopického vybavení Laboratoře mikroskopie Ústavu dědičných metabolických poruch Ke Karlovu 2, Praha 2, budova E1a, 2.patro (http://www1.lf1.cuni.cz/udmp/Microscopy/index.php). Obsahem kurzu jsou vedle teoretických částí také modelová praktická cvičení příprava a pozorování fluorescenčně značených fixovaných ale i živých buněk, dále pak práce se sft určeným pro zpracování a restoraci (dekonvoluci) obrazu.

Účastníci kurzu budou vybráni z přihlášených studentů na základě stručného motivačního dopisu (max. 200 slov). Podmínkou pro zápočet je 100% účast na kurzu (cca 18 hodin). Postgraduálním studentům bude započet uznán po předchozím individuálním projednání s příslušnou oborovou radou. Pro oborovou radu Biochemie a patobiochemie byl již kurz schválen. Přesné termíny kurzu budou oznámeny v prvni tretine zimního i letního semestru prostřednictvím informačního systému UK a www stránek mikroskopické facility (http://www1.lf1.cuni.cz/udmp/Microscopy/index.php ).

S ohledem na specifitu kurzu nelze vyloucit ucast anglicky mluvicich studentu, tzn. kazdy zajemce by se mel vyjadrit k moznosti absolvovat kurz v anglictine, jazyk bude zvolen dle skladby ucastniku.