VP - Analýza dat v R a vybrané kapitoly ze statistiky

Sylabus

Název studijního předmětu: Analýza dat v R a vybrané kapitoly ze statistiky

Název studijního předmětu - anglicky: Data analysis in R and selected topics in statistics

Předmět je určen doktorandům a všem studentům pregraduálního studia, kteří uvažují, že by část své kariéry strávili vědeckou prací. Kurz navazuje na seminář “Uvedení do R a analýzy dat”. Tento předmět není formální prerekvizitou a studenti si mohou kurz zapsat samostatně, předpokládají se nicméně základní znalosti prostředí a jazyka R. Cílem kurzu je vyložit některé analytické metody často používané v moderním biomedicínském výzkumu a naučit je prakticky aplikovat. Témata a hloubka do jaké se jim věnujeme je volena do značné míry podle odborného zájmu posluchačů. Základní témata: 1) pravděpodobnost, 2) moderní regresní metody (lineární a zobecněné lineární modely, analýza přežívání), 3) transformace a zobrazení dat.

Rozšiřující témata (podle zájmu posluchačů): analýza dat v průtokové cytometrii, sekvenovaní nové generace, expresní profilování, analýza časových řad, metody se smíšenými efekty, dimenzionální redukce, umělé neuronové sítě, ... Po domluvě lze zařadit další témata podle zájmu.

Garant: prof.Starý

Odpovědná osoba: doc. Šrámková

Typ předmětu: volitelný

Rozsah studijního předmětu: 2 hodiny týdně, 10 týdnů

Začátek: 21.2. - 22.5.2024 každý týden ve středu (nebo dle dohody), 14:00 - 15:30

Určeno pro ročníky: PGS a 1.-6. pregraduální

Počet studentů: 3-10

Způsob zakončení: Zápočet

Místo konání: budova "nová onkologie"

Anotace

Předmět je určen doktorandům a všem studentům pregraduálního studia, kteří uvažují, že by část své kariéry strávili vědeckou prací.

Kurz navazuje na seminář “Uvedení do R a analýzy dat”. Tento předmět není formální prerekvizitou a studenti si mohou kurz zapsat samostatně, předpokládají se nicméně základní znalosti prostředí a jazyka R.

Cílem kurzu je vyložit některé analytické metody často používané v moderním biomedicínském výzkumu a naučit je prakticky aplikovat. Témata a hloubka do jaké se jim věnujeme je volena do značné míry podle odborného zájmu posluchačů. Základní témata: 1) pravděpodobnost, 2) moderní regresní metody (lineární a zobecněné lineární modely, analýza přežívání), 3) transformace a zobrazení dat.

Rozšiřující témata (podle zájmu posluchačů): analýza dat v průtokové cytometrii, sekvenovaní nové generace, expresní profilování, analýza časových řad, metody se smíšenými efekty, dimenzionální redukce, grafické modely,

Simpsonův paradox a kausalita,... Po domluvě lze zařadit další témata podle zájmu.