Syllabus
Cílem předmětu je seznámit studenty s problematikou rezistence bakteriálních patogenů k antimikrobiálním látkám, což představuje jedno ze zásadních zdravotnických témat dneška.
Předmět bude kombinací teoretické a praktické části. V teoretické části bude nastíněna problematika antimikrobiální rezistence, jejího vzniku a šíření rezistentních bakterií mezi humánní sférou (nemocnicí a komunitou), veterinární sférou a prostředím, včetně faktorů selektujících rezistenci. Dále se budeme věnovat detekci a monitorování výskytu rezistentních bakterií, prevenci jejich šíření, dezinfekčním a antiseptickým přípravkům a alternativám k antimikrobiálním látkám. V praktické části si studenti vyzkouší laboratorní postupy používané k záchytu a identifikaci rezistentních bakterií, včetně různých metod testování antimikrobiální citlivosti, selektivní kultivace, průkazu genů rezistence a interpretace výsledků. Studenti si dle zájmu a vlastního uvážení budou moci vyzkoušet také odběr a kultivaci svých vlastních vzorků s následnou interpretací, což jim umožní náhled do vlastního „mikrobiomu“. Program: Pondělí (Mgr. Jan
Tkadlec, Ph.D.): Teorie: Úvod - historie a perspektivy vzniku a šíření antimikrobiální rezistence; mechanismy rezistence, heterorezistence, perzistence a tolerance k antibiotikům Praxe: Postup selektivní kultivace rezistentních patogenů - odběr vzorků, očkování půd. Úterý (MUDr. Václav
Vaniš): Teorie: Rezistentní bakterie v nemocnici - rizikové skupiny pacientů; antibiotická politika a spotřeba antibiotik Praxe: Metody testování citlivosti k antibiotikům - provedení diskové difuzní metody, e-testu, určení minimální inhibiční koncentrace; fenotypové testy určení mechanismu rezistence - inducibilní rezistence k linkosamidům, betalaktamázy. Středa (MUDr. Václav Vaniš):
Teorie: Prevence šíření rezistentních bakterií, nemocniční outbreaky, dezinfekce, antiseptika.
Praxe: Výsledky testování citlivosti a jejích interpretace. Čtvrtek (Mgr. Marcela Krůtová, Ph.D.):
Teorie: Rezistentní bakterie mimo nemocnici - komunita (komunitní MRSA), zvířata jako zdroj rezistentních bakterií a rizikové skupiny osob, antibiotika a rezistentní bakterie v prostředí kolem nás. Praxe: Detekce ATB rezistence a monitorování šíření rezistentních bakterií pomocí PCR a celogenomového sekvenování - metody molekulární epidemiologie, analýza dat, bioinformatické nástroje, možnosti a limitace, Pátek (Mgr. Jan Tkadlec, Ph.D.): Teorie: Odvrácená strana antibiotické léčby - rozvracený mikrobiom a související choroby; alternativy k antibiotikům - probiotika, fekální transplantace, bakteriofágy