Syllabus
Přednášky: Úvod do studia - význam mikrobiologie, obsah předmětu, historie lékařské mikrobiologie, stavba prokaryotických a eukaryotických organismů (viry, bakterie, houby, plísně, paraziti). Obecná bakteriologie -stavba a fyziologie bakteriální buňky, vztahy mezi makroorganizmem a mikroorganizmem - patogenita a virulence bakterií, kontagiozita, invazivita , toxicita bakterií. Antibiotika a chemoterapeutika - dělení a charakteristika základních skupin, mechanizmus účinku na buňku, mechanizmy vzniku a epidemiologie rezistence, principy racionální antibiotické terapie. Bakteriologie - taxonomie bakterií, hlediska dělení bakterií do skupin. Přehled lékařsky významných bakterií. Rody Staphylococcus, Streptococcus, Enterococcus, Peptostreptococcus, Bacteroides, Listeria, Lactobacillus, Bacillus, Clostridium, Corynebacterium a příbuzné rody, rody Neisseria, Branhamella, Moraxella, Acinetobacter, čeleď Enterobacteriaceae, rody Vibrio, Haemophilus, Campylobacter, Helicobacter, Pseudomonas, Burkholderia, Stenotrophomonas, Bordetella, Legionella, Brucella, Franciscella. Rod Mycobacterium, Mycoplasma, Ureaplasma. Ricketsie. Spirochety - rody Treponema, Borrelia a Leptospira. Základní morfologické, fyziologické a patogenní vlastnosti jednotlivých mikroorganizmů. Jejich zdroje a možnosti přenosu při infekci člověka. Mechanizmus vzniku onemocnění, základní klinické příznaky nemoci, prevence, terapie a epidemiologie. Jejich výskyt a vliv na mikroflóru dutiny ústní. Virologie - taxonomie virů, hlediska dělení virů do skupin. Obecná virologie - stavba, fyziologie, genetika. Specifita virových infekcí. Antivirotika. Přehled lékařsky významných skupin virů. Čeledi Poxviridae, Herpesviridae, Adenoviridae, Papovaviridae a Parvoviridae. Čeledi Picornaviridae, Caliciviridae, Reoviridae, Togaviridae, Flaviviridae, Buniaviridae, Orthomyxoviridae, Paramyxoviridae, Rhabdoviridae, Filoviridae, Retroviridae, Arenaviridae a Coronaviridae. Základní morfologické, fyziologické a patogenní vlastnosti jednotlivých virů. Jejich zdroje a možnosti přenosu při infekci člověka. Mechanizmus vzniku onemocnění, základní klinické příznaky nemoci, prevence, terapie a epidemiologie. Jejich výskyt a vliv na mikroflóru dutiny ústní. Mykologie - taxonomie hub, hlediska dělení hub do skupin. Obecná mykologie - stavba, fyziologie, genetika. Specifita mykotických infekcí. Tropické mykózy. Antimykotika. Přehled lékařsky významných hub. Rody Candida, Cryptococcus, Aspergillus, Penicillium, Mucor, Rhizopus, Chrysosporium, Trichophyton, Epidermophyton, Microsporum, Pityrosporum, Sporotrichum. Pneumocystis carinii. Základní morfologické, fyziologické a patogenní vlatnosti jednotlivých hub. Jejich zdroje a možnosti přenosu při infekci člověka. Mechanizmus vzniku onemocnění, základní klinické příznaky nemoci, prevence, terapie a epidemiologie. Jejich výskyt a vliv na mikroflóru dutiny ústní. Parazitologie - taxonomie parazitů, hlediska jejich dělení. Základní charakteristika jednotlivých lékařsky významných skupin parazitů (Protozoa, Vermes, Arthropoda) - stavba, fyziologie, genetika. Specifita parazitárních infekcí. Tropické parazitózy. Antiparazitika. Přehled lékařsky významných parazit. Protozoa (prvoci) - rody Entamoeba, Acantamoeba, Naegleria, Trichomonas, Leishmania, Trypanozoma, Giardia, Balantidium, Toxoplasma, Plasmodium, Cryptosporidium. Nematoda (hlístice) - Dracunculus, Wuchereria, Onchocerca, Brugia, Enterobius, Ascaris, Trichuris, Ancylostoma. Trematoda (motolice) - Schistosoma. Cestoda (tasemnice) - Taenia, Hymenolepis, Diphylobotrium, Echinococcus. Arthropoda (členovci) - Ixodes, Pulex, Cimex, Pediculus, Sarcoptes. Základní morfologické, fyziologické a patogenní vlastnosti jednotlivých parazitů. Jejich zdroje a možnosti přenosu při infekci člověka. Mechanizmus vzniku onemocnění, základní klinické příznaky nemoci, prevence, terapie a epidemiologie. Jejich výskyt a vliv na mikroflóru dutiny ústní. Infekce spojené s nemocniční péčí, infekce imunosuprimovaných pacientů. Význam, specifita a nejčastější původci těchto infekcí a jejich rezistence na antibiotika. Mikrobi
Praktická výuka: Dezinfekce a sterilizace, Základní pojmy, metody dezinfekce a sterilizace, význam v prevenci infekcí, Odběr, transport a zpracování infekčního materiálu, Hlavní zásady správného odběru jednotlivých typů materiálu k mikrobiologickému vyšetření a jeho správný transport do mikrobiologické laboratoře. Postup při zpracování materiálu v mikrobiologické laboratoři. Mikroskopické vyšetřovací metody. Využití mikroskopie v bakteriologii, mykologii, virologii a parazitologii. Druhy používaných preparátů a barvicích postupů. Postup při mikroskopování preparátů s imerzí. Samostatná příprava, barvení a hodnocení preparátů. Kultivační vyšetřovací metody. Využití kultivačních metod v bakteriologii, mykologii, virologii a parazitologii. Základní podmínky a metody kultivace. Dělení a druhy kultivačních půd. Hodnocení růstu bakterií. Základní metody laboratorní identifikace mikroorganizmů. Metody detekce citlivosti bakterií na antibiotika. Samostatné zpracování materiálu, popis kolonií a identifikace mikroorganizmů. Imunologické metody. Využití serologických metod v bakteriologii, mykologii, virologii a parazitologii. Jednotlivé složky serologických reakcí, jejich charakteristika. Průběh serologických reakcí. Základní serologické metody - aglutinace, precipitace, imunodifúze a elektoforéza, reakce vazby komplementu, reakce se značenými složkami - imunofluorescence, radioimunoanalýza, enzymoimunoanalýza (ELISA). Imunoblotting, PCR. Hodnocení serologických reakcí, problematika interpretace serologických výsledků. Fyziologická mikroflora člověka, mikrobiologie dutiny ústní - základní přehled a význam u zdravé populace. Laboratorní diagnostika infekcí vyvolaných anaeroby. Laboratorní diagnostika virů. Laboratorní diagnostika patogenních hub. Laboratorní diagnostika parazitů . Laboratorní diagnostika původců infekcí kůže, sliznic a měkkých tkání. Laboratorní diagnostika původců pohlavně přenosných infekcí. Laboratorní diagnostika původců močových a střevních infekcí. Laboratorní diagnostika původců infekcí dýchacích cest. Laboratorní diagnostika původců infekcí CNS a septických stavů.
Annotation
Během výuky získají studenti základní znalosti o lékařsky významných bakteriích, virech, houbách a parazitech, o úloze fyziologické mikroflóry a o principech patogenního působení mikroorganizmu na hostitele. Součástí získaných znalostí je i problematika specifické prevence a terapie mikrobiálních infekcí a informace o epidemiologii infekčních onemocnění a o nových poznatcích v oboru mikrobiologie. Nedílnou součástí oboru je moderní antibiotická politika včetně rezistencí na antibiotika a mechanizmů jejich vzniku.
Během praktické výuky získají studenti základní dovednosti v odběru materiálu na mikrobiologické vyšetření, v laboratorní diagnostice jednotlivých skupin mikroorganizmů a diagnostice infekčních agens v jednotlivých systémových soustavách člověka. Získají o nově zaváděných postupech.