Ve farmakologii přednášené v 6. semestru je největší důraz kladen na tzv. obecnou farmakologii, kde je student seznamován především s problematikou osudu léčiv v organismu (farmakokinetikou) a s jejich mechanismem působení na molekulární úrovni (farmakodynamikou), tak aby byl schopen si odvodit sám řadu informací ze systémové farmakologie. Obecná farmakologie je zdůrazňována i s ohledem na tu skutečnost, že farmaceut v praxi bude muset v tomto ohledu pomáhat v orientaci nejen pacientovi ale i lékaři.