V průběhu SDZ je ověřována znalost doktoranda z následujících oblastí:
Vybrané kapitoly z farmakologie se zaměřením na disertační práci;
Obecná biochemie (chemické struktury látek podílejících se na stavbě a funkci organismu, enzymologie, metabolické cesty, intercelulární a intracelulární signalizace);
Molekulární biologie (biochemie přenosu dědičné informace, proteosyntézy, regulace exprese genů, metody molekulární biologie);
Xenobiochemie (obecné metabolické cesty látek tělu cizích, speciální xenobiochemie se zaměřením na předmět disertační práce);
Patobiochemie (molekulární základ chorob, biochemický výklad chorob a patologických stavů s vysokou incidencí v lidské populaci - dyslipoproteinemie, atherosklerosa, diabetes, nádorová transformace, biochemie zánětu), molekulární patologie chorob a stavů souvisejících s problematikou disertační práce;
Laboratorní techniky biochemie v diagnostice chorob (metody, postupy, interpretace).
Tematické okruhy jednotlivých disciplin jsou předem specifikovány v souladu se zaměřením disertační práce.
Zkoušený dostane v průběhu státní zkoušky zpravidla (nejméně) 4 otázky. Vždy jsou položeny otázky z patobiochemie a z xenobiochemie, další otázky jsou podle zaměření disertační práce.