Sylabus
Porovnanie fenetického a kladistického (parsimonického) prístupu k rekonštrukcii evolučných vzťahov, ich výhody a nevýhody, možnosti alternatívnych prístupov (metóda najväčšej vieryhodnosti, Bayesova metóda); prehľad multivariačných metód používaných v taxonómii; osobitosti geometrickej morfometriky.
Klasifikácia znakov a ich použitie; koeficienty vyjadrujúce vzťahy medzi znakmi alebo objektmi; genetické vzdialenosti; štandardizácia a transformácia dát.
Zhluková analýza; metódy zhlukovej analýzy, výhody a nevýhody jednotlivých metód; zhody (ties).
Ordinačné metódy; analýza hlavných komponentov (PCA), geometrická interpretácia, typy PCA; analýza hlavných koordinát; nemetrické mnohorozmerné škálovanie, stres.
Diskriminačná analýza, požiadavky na dáta; kanonická diskriminačná analýza; klasifikačná diskriminačná analýza, klasifikačné pravidlá; kroková diskriminačná analýza.
Analýza tvaru, geometrická morfometrika; význačné body (landmarks); Booksteinove súradnice tvaru; Prokrustova analýza; metóda ohybných páskov (thin plate spline), deformácie; obrysová analýza (analýza vlastných tvarov, Fourierova analýza).
Anotace
Cieľom prednášok je oboznámenie s teoretickými základmi a praktickým uplatnením multivariačných metód v taxonómii. Osobitná pozornosť sa venuje analýze hlavných komponentov, analýze hlavných koordinát, zhlukovej analýze a rôznym typom diskriminačnej analýzy. Osobitná časť prednášky je venovaná geometrickej morfometrike (analýze tvaru). Praktické cvičenia si kladú za cieľ oboznámiť študentov s počitačovými programami používanými v morfometrických štúdiách. Ide predovšetkým o programy SYN-TAX 2000 a R.
Na predmet nadväzujú prednášky a cvičenia Kladistika a další metody rekonstrukce evoluce - MB120P83.