Sylabus
Kurs má část teoretickou (přednášky, demonstrace analýzy dat a modelování), a část praktickou (analýza a modelování dat přinesených posluchači, nebo dat, která přinesou přednášející). Závěrem kursu posluchači vypracují krátký report o vybraném zpracovávaném problému, který přednesou a obhájí na společném sezení.
Náplň cyklu vychází z problémů a technik, které uvádíme v manuálu pro analýzu dat v populační biologii (Herben a Münzbergová: Zpracování geobotanických dat v příkladech - Část II. Demografická data). Obsah se mezi jednotlivými běhy trochu mění. Jednotlivé okruhy:
- analýza dat o natalitě a mortalitě: logistická regrese, analýza přežívání
- analýza dat o růstu rostlin
- analýza dat o kvetení, produkci semen, analýza dat z polinačních pokusů: Poissonovská regrese
- analýza dat o klíčení a přežívání semenáčků, analýza dat o přežívání semen v půdě
- identifikace jednosměrných vztahů v datových souborech pomocí parciální regrese a path analysis
- konstrukce populačních přechodových matic, kritika sebraných dat
- maticové modelování populační dynamiky: stabilní věková struktura, růstová rychlost, její variabilita, průměrná délka života
- elasticita, příspěvky jednotlivých fází k růstové rychlosti, zjišťování "kritických" fází
- spolehlivost predikcí maticových modelů
- metapopulační dynamika: stanovení parametrů křivky šíření, metapopulační kapacity
- metapopulační dynamika: modelování šíření druhu v krajině s explicitní strukturou
- analýza dat na úrovni populace
Anotace
Předmět je vyučován anglicky v případě přítomnosti zahraničních studentů.
Cílem praktika je podat přehled běžných postupů ve dvou oblastech:
? analýza běžných datových souborů v populační biologii rostlin
? použití základních technik pro modelování v populační biologii a jejich aplikace v praktických situacích
? seznámení s možným softwarovým vybavením pro práci v populační biologii (zejména Matlab a S-plus)