Sylabus
Rozvrh lekcí pro zimní semestr šk. roku 2020/21 e-mail: mkolarik@biomed.cas.cz, tel. 777880129
Kde?Kolokvium OŽP, Benátská 2 (učebna vedle vrátnice)
Kdy? čtvrtek 12:20 - 14:35
Kdo? Miroslav Kolařík (katedra botaniky Přf UK/MB Ú AVČR)
Milan Gryndler (UJEP Ústí nad Labem)
Ondřej Koukol (katedra botaniky Přf UK)
Karel Prášil (katedra botaniky Přf UK)
Jan Holec (Národní Muzeum v Praze)
Miroslav Flieger (MBÚ AVČR)
ÚVOD A ORGANIZMÁLNÍ ÚROVEŇ 1. Názory na klasifikaci a postavení v říších živých organizmů. 2. Nepohlavní rozmnožování a struktury s ním spojené, základní typy konidiogeneze. 1. lekce (Prášil) čtvrtek 1.10.
GENETIKA HUB 1. Houby jako modelové organismy. Genetické aspekty sexuální reprodukce u hub. 2. Genetické aspekty asexuální reprodukce u hub. Indukce sporulace. Parasexuální hybridizace. 2. lekce (Kolařík) čtvrtek 8.10 3. Stavba houbového genomu. Průtoková cytometrie u hub. 4. Základy molekulární taxonomie hub, izolace houbové DNA. Povaha a typy molekulárních znaků používaných v mykologii. Biochemické markery. 3. lekce (Kolařík) čtvrtek 15.10 5. DNA sekvence, jejich zpracování a práce s databázemi. PCR fingerprinting. Analýza environmentálních vzorků. 4. lekce (Kolařík) čtvrtek 22. 10. 6. Příklady využití v taxonomii a populační genetice. Definice druhu. Studium speciace a vymezení druhové hranice u hub. Využití mol. metod při studiu diverzity hub. 5. lekce (Kolařík) čtvrtek 29.10
FYZIOLOGIE HUB 1. Úvod, příjem živin a fyziologie výživy, transport, houby a těžké kovy. Fyziologie růstu a rozmnožování. 6. lekce (Gryndler) čtvrtek 5.11 2. Vliv fyzikálních a chemických vlastností prostředí na houbový organizmus. Komunikace a přenos informací mezi houbovou buňkou a vnějším prostředím. 7. lekce (Gryndler) čtvrtek 12.11
SEKUNDÁRNÍ METABOLISMU – BIOLOGICKY AKTIVNÍ LÁTKY 1. Mykotoxiny - výskyt a význam, základní typy onemocnění. Rozdělení dle způsobu biosyntézy. Mykotoxiny a jejich koncentrace v potravinách. Faktory růstu a produkce. 2 Přehled základních mykotoxinů: struktura, výskyt, význam, limity, toxicita, stabilita 8. lekce (Flieger) čtvrtek 19. 11 3 Metodická průprava. Extrakci, purifikaci, separaci a detekci. TLC, HPLC, MS, NMR. Identifikace neznámých látek. 9. lekce (Flieger) čtvrtek 26.11
BIODIVERZITA HUB 1. Biodiverzita hub v ČR, Evropě a ve světě, metody studia biodiverzity hub. 2. Počty druhů hub v různých ekosystémech a v různých částech světa. 3. Faktory ovlivňující biodiverzitu hub na nejrůznějších úrovních s příklady z některých dobře prozkoumaných skupin hub. 10. lekce (Holec) čtvrtek 3.12
EKOLOGIE HUB 1. Dekompozice opadu, půda. Typy rozkladu dřeva. Koprofilní, keratinofilní a anthrakofilní houby. Houby v horninách a nerostech, zvětrávání. Houby ve vodním prostředí. 11. lekce (Koukol) čtvrtek 10.12 2. Endofyti a další symbiózy s rostlinami. Trofické interakce hub s bakteriemi, protisty, bezobratlými a obratlovci. Nematofágní houby a houby asociované s hmyzem. Kompetice hub. 12. lekce (Koukol) čtvrtek 17.12
Anotace
Přednáška podává základní přehled o morfologii, evoluci, genetice, diverzitě a sekundárním metabolismu hub. Jednotlivé lekce shrnují: 1) názory na klasifikaci hub, nepohlavní rozmnožování a struktury s ním spojené, konidiogeneze, 3) houby jako modelové organismy, genetické aspekty sexuální a asexuální reprodukce u hub, stavba genomu, základy molekulární taxonomie hub, analýza environmentálních vzorků, 4) využití mol. genetiky v taxonomii a populační genetice, definice druhu, studium speciace a vymezení druhové hranice u hub, 5) příjem živin a fyziologie výživy, transport, těžké kovy, fyziologie růstu a rozmnožování, vliv fyzikálních a chemických vlastností prostředí na houbový organizmus, komunikace a přenos informací mezi houbovou buňkou a vnějším prostředím, 6) sekundární metabolismus hub – mykotoxiny, biosyntéza, faktory růstu a produkce a metodická průprava (extrakce, purifikace a identifikace), 7) biodiverzitu hub v ČR, Evropě a ve světě, metody studia biodiverzity hub, faktory ovlivňující biodiverzitu hub, 8) dekompozice opadu, houby v půda, typy rozkladu dřeva, koprofilní, keratinofilní a anthrakofilní houby, huby v horninách a nerostech, zvětrávání, houby ve vodním prostředí, symbiózy, kompetice hub.