Syllabus
1) V teoretické části budou stručně diskutovány základní techniky genového inženýrství s důrazem na ty, které budou použity v praktické části:
PCR, sekvenování, analytická elektroforetická separace proteinů a nukleových kyselin, DNA vektory, genomové a cDNA knihovny. Základní molekulárně biologické databáze (NCBI-NIH atd). Krátce i využití těchto metod a databází v lékařské, soudní a biotechnologické praxi. Před detailním popisem metod bude dávána přednost jejich aktualizaci v souladu se současnými znalostmi publikovanými v odborných i laických médiích širokého dosahu. Předpokládá se možnost aktuálních změn v reakci na dotazy a potřeby zúčastněných studentů. 2) V demonstrační části budou ukazovány některé náročnější metody diskutované v teoretické části dle aktuálních možností (např. pozorování exprese cizorodých bílkovin v kultuře E.coli - proteinová elektroforéza, sledování fluorescence zeleného fluorescenčního proteinu in vivo). 3) V praktické části si každý student vyzkouší mapování DNA restrikčními endonuklázami, polymerasovou řetězovou reakci (PCR), detekci nukleových kyselin pomocí agarosové elektroforézy, srážení nukleových kyselin pomocí alkoholu a solí.
Studenti si vyzkouší volně dostupné počítačové programy pro navrhování DNA primerů pro PCR a programy pro klonování in silico a další teoretické úlohy s využitím veřejných mol.biol. databází.
Studenti ukončí praktikum vypracováním protokolů a složením zápočtového testu. Více informací, texty, protokoly a presentace jsou pro studenty zapsané do kurzu k dispozici na http://web.natur.cuni.cz/~pospisek
Annotation
Cvičení sestává z teoretické, demonstrační a praktické části. Před cvičením je doporučeno absolvovat alespoň jednu z následujících přednášek: Základy molekulární biologie, Molekulární biologie, Biologie buňky, Biochemie, Genetika ale není to podmínkou.