\r\n
two prokaryotic realms and their discovery, LUCA and its predicted feaures, prokaryotic influence on early ecosystems, eukaryogenesis from archaea
\r\nSystematics I
\r\nTerrabacteria: major taxa, their evolution and distinctive traits
\r\nSystematics II
\r\nHydrobacteria: major taxa, their evolution and distinctive traits
\r\nSources and mechanisms of evolutionary variability
point mutations, frameshift mutations (contingency loci), IS elements, hypermutability (mutation rate, evolution of evolvability), horizontal gene transfer and mobile genetic elements
\r\nEvolution of patogenicity
\r\nevolutionary trajectory from a fre--living to pathogenic bacterium, immune evasion, obligate host association, genetically monomorpic pathogens
\r\nEvolution of defence
protection from MGE (CRISPR,RM systems), protection of MGE from host defenses, evolution of ATB resistance
\r\nEvoluce kooperace
\r\nnutritional symbioses (sap-feeding insects, hydrothermal vents, rhizobia), bioluminescent symbioses
","inLanguage":"en"}]}Molekulární taxonomie, prokaryotní druh prokaryotní x eukaryotní druh, fylogenetické markery a jejich citlivost, jednogenové x vícegenové x celogenomové přístupy
Raná evoluce prokaryot a hlavní členění hlavní členění prokaryot a jeho objev, LUCA a jeho predikované vlastnosti, prokaryota jako hybatelé rané evoluce planetárního ekosystému, vznik eukaryot z archeí
Systematika I
Terrabacteria: nejdůležitější taxony, jejich evoluce a znaky
Systematika II
Hydrobacteria: nejdůležitější taxony, jejich evoluce a znaky
Zdroje a mechanismy evoluční variability bodové mutace, posuvové mutace (contingency loci), repetitivní sekvence, IS elementy, hypermutabilita (mutační rychlost, evoluce evolvability), horizontální genový přenos a mobilní genetické elementy (taxonomická specificita)
Evoluce patogenicity evoluční trajektorie od volně žijící bakterie k patogenovi, adaptace na imunitní systém, intracelularita, obligátní asociace s hostitelem, geneticky monomorfní patogeny
Evoluce obrany obrana prokaryot před sobeckými genetickými elementy (CRISPR, restrikčně – modifikační systémy), obranné mechanismy sobeckých elementů před obrannými mechanismy hostitele, evoluce rezistence k antibiotikům
Evoluce kooperace nutriční symbiózy (mízosavý hmyz, hydrotermální vývěry, hlízkové bakterie), bioluminiscentní symbiózy
Přednáška poskytuje globální přehled aktuálních znalostí o evoluci prokaryot a jejich taxonomii. V části zaměřené na systematickou mikrobiologii pojednává o taxonomických přístupech a charakterizuje nejvýznamnější prokaryotní taxony. V evoluční části přednášky je kladen důraz na fenomény spojené s evolucí charakteristických životních stylů prokaryot (nutriční symbionti, patogeni). Zvláštní pozornost je dále věnována zdrojům evoluční variability a evoluci obrany před selekčními tlaky biologické povahy (sobecké genetické elementy, antibiotika, imunitní systém hostitele).
Předmět je vhodný především pro magisterské a doktorské studenty mikrobiologie, vítáni jsou zájemci z jiných oborů. Pro porozumění probíraným tématům se doporučuje předchozí absolvování přednášek Mikrobiologie a Základy evoluční biologie.