Sylabus
Molekulární taxonomie, prokaryotní druh prokaryotní x eukaryotní druh, fylogenetické markery a jejich citlivost, jednogenové x vícegenové x celogenomové přístupy
Raná evoluce prokaryot a hlavní členění hlavní členění prokaryot a jeho objev, LUCA a jeho predikované vlastnosti, prokaryota jako hybatelé rané evoluce planetárního ekosystému, vznik eukaryot z archeí
Systematika I
Terrabacteria: nejdůležitější taxony, jejich evoluce a znaky
Systematika II
Hydrobacteria: nejdůležitější taxony, jejich evoluce a znaky
Zdroje a mechanismy evoluční variability bodové mutace, posuvové mutace (contingency loci), repetitivní sekvence, IS elementy, hypermutabilita (mutační rychlost, evoluce evolvability), horizontální genový přenos a mobilní genetické elementy (taxonomická specificita)
Evoluce patogenicity evoluční trajektorie od volně žijící bakterie k patogenovi, adaptace na imunitní systém, intracelularita, obligátní asociace s hostitelem, geneticky monomorfní patogeny
Evoluce obrany obrana prokaryot před sobeckými genetickými elementy (CRISPR, restrikčně – modifikační systémy), obranné mechanismy sobeckých elementů před obrannými mechanismy hostitele, evoluce rezistence k antibiotikům
Evoluce kooperace nutriční symbiózy (mízosavý hmyz, hydrotermální vývěry, hlízkové bakterie), bioluminiscentní symbiózy
Anotace
Přednáška poskytuje globální přehled aktuálních znalostí o evoluci prokaryot a jejich taxonomii. V části zaměřené na systematickou mikrobiologii pojednává o taxonomických přístupech a charakterizuje nejvýznamnější prokaryotní taxony. V evoluční části přednášky je kladen důraz na fenomény spojené s evolucí charakteristických životních stylů prokaryot (nutriční symbionti, patogeni). Zvláštní pozornost je dále věnována zdrojům evoluční variability a evoluci obrany před selekčními tlaky biologické povahy (sobecké genetické elementy, antibiotika, imunitní systém hostitele).
Předmět je vhodný především pro magisterské a doktorské studenty mikrobiologie, vítáni jsou zájemci z jiných oborů. Pro porozumění probíraným tématům se doporučuje předchozí absolvování přednášek Mikrobiologie a Základy evoluční biologie.