Struktura biologických makromolekul

Sylabus

1. Peptidy a globulární proteiny. Základní strukturní pojmy a charakteristiky. Metody popisu a znázornění struktury - vnitřní souřadnice, diedrální úhly, disanční a direkční matice. Hierarchizace struktury - primární, sekundární, terciární, kvartérní, pojetí komise IUB/IUPAC, klasické pojetí. Supersekundární struktura, strukturní motivy a domény. Strukturní klasifikace proteinů. Predikce a modelování struktury proteinů - základní metodické přístupy, limity a monnosti. Porovnávání sekvencí a struktur. Dynamika a sbalování nativní struktury, denaturace. Proteiny v extrémních podmínkách.Membránové proteiny.

2. Nukleové kyseliny. Základní pojmy, metody popisu. Vzájemné vztahy vnitřních souřadnic, metody přibližného popisu prostorové struktury. DNA, RNA - strukturní typy, párování bazí, strukturní charakteristiky dvoušroubovice, Z-DNA a trojšroubovice.

3. Polysacharidy. Základní popis, strukturní typy. Škrob, celulosa, heparin, pektiny.

4. Podpůrné struktury. Obecné principy struktury biologických stavebních prvků. Vláknité bílkoviny - fibriny, kolageny, keratiny, fibroin. Proteoglykany. Lignin.

5. Přeměna chemické energie na mechanickou. Svalové bílkoviny. Bičíky a řasinky.

Anotace

Struktura biologických makromolekul

Základy strukturní analýzy biopolymerů, metody popisu, srovnávání a predikce.

Proteiny a polypeptidy, sbalování a stabilita, evoluce, strukturní třídy. Nukleové kyseliny, nomenklatura. Polysacharidy, glykoproteiny a proteoglykany. Lignin. Supramolekulární struktury, viriony, priony. Podpůrné struktury. Přeměna chemické energie v mechanickou.