Sylabus
Krystalografie: krystalizace proteinů v různých podmínkách, vybírání krystalů a nastavení difrakce, zpracovaní difračních dat, fitování struktury do elektronové hustoty.
NMR: příprava titrační řady ke sledování proteinové interakce, snímání dat na spektrometru, vyhodnocení vazby k proteinu, přiřazení rezonancní lavního řetězce.
Vyhodnocení strukturních dat, proteinová strukturní databáze, hledání strukturně podobných proteinů, predikce sekundární struktury, práce s programy pro zobrazování struktur biomolekul.
Anotace
Praktikum je určeno primárně pro studenty magisterského a doktorského studia. Cílem praktika je seznámit studenty s technikami strukturní biologie (biomolekulární krystalografií a NMR spektroskopií). Praktikum je turnusové a bude probíhat na Ústavu organické chemie a biochemie AV ČR v posledním týdnu semestru nebo prvním týdnu zkouškového období dle možností zapsaných studentů.
Před praktikem je výhodou znalost základů technik NMR a proteinové krystalografie, např. předměty Biofyzikální chemie I a II, Řešení trojrozměrné struktury makromolekul.
Pokud bude naplněna kapacita a nebude možné si praktikum zapsat, zvážíme její navýšení. Kontaktujte mě přes email: veverka@uochb.cas.cz