Pokračování diplomového projektu. Detailní popis viz předmět „Diplomový projekt 1 (Medicinální chemie).“
Studenti pracují na zvolených projektech, a o průběhu prací jsou informování vedoucí práce. Zárověň v tomto období referují studenti na společném semináři o tom, na jaké téma se přihlásili, a jakým způsobem příslušné téma rozpracují.