Sylabus
Studenti si během teoretické části osvojí:
1) Základní znalosti z molekulární biologie a genetiky týkající se struktury a dynamiky DNA - formou přednášek, workshopu a promítání krátkých animací z oblasti molekulární biologie a genetiky.
2) Aspekty molekulární biologie, jichž se využívá v technologiích pracujících s fosilní DNA
3) Podmínky pro uchování DNA ve fosilním záznamu, typy degradace a modifikace DNA v zavislosti na sedimentačním prostředí.
4) Diagnostika fosilií před vlastním zpracováním fosilní DNA - nepřímý odhad zachování DNA.
5) Oblasti využití molekulární paleontologie s konkrétními příklady.
6) Technologie umožňující molekulárně-paleontologický výzkum.
7) Metody práce se starou DNA a jejich specifika.
8) Evoluce genomu, paleogenomika - paleopolyploidizace a další mechanizmy: genetická exkurze do historie života, hypotesa 2R a její následky pro současnost. Teoretická/virtuální molekulární paleontologie. V případě možnosti a zájmu bude kurz završen praktickým cvičením v laboratoři (extrakce recentní, subrecentní a fosilní DNA, srovnání výsledků), ideálně zpracování autentického materiálu, který se bude právě zpracovávat v laboratoři. Forma výuky: 8 teoretických lekcí, zpracování samostatné práce a její vyhodnocení Požadavky ke zkoušce: Vypracování návrhu projektu (3-5 stran) s event. využitím metod molekulární paleontologie ve svém vlastním zaměření (důraz je kladen na kontext, ve kterém by se uvedené metody aplikovaly, tzn. konkrétní problém řešený klasickými metodami a následně doplněn o molekulárně paleontologický přístup), včetně presentace projektu a diskuse. Vlastní zkouška: první část písemka (ca. 10 otázek) a pak dle zvládnutí písemky ještě ústní část v podobě diskuse nad písemkou. Studenti ke každé přednášce dostávají vytištěné presentace, kt. jim slouží jako základní materiál k přípravě na zkoušku.
Anotace
zprostředkovat znalosti z biologie nezbytné pro pochopení základních aspektů molekulární paleontologie a principů jejího studia