- Rovnovážné fluktuace fyzikálních veličin (pravděpodobnostní popis, fluktuace v Gibbsovych souborech, Einsteinova kvazi-termodynamická teorie fluktuaci)
- Tepelné šumy (Johnson-Nyquist, Langevin), stochastické procesy (Gaussovské, stacionární, korelace, spektrum), stochastické diferenciální rovnice, fluktuačně-disipační věta (Einstein, Callen-Welton)
- Fenomenologická lineární nerovnovážná termodynamika (transportní koeficienty, Onsagerovy relace reciprocity, zobecněné susceptibility), odezva dvouhladinového atomu
- Úvod do chemické termodynamiky (parciální molární veličiny, standardní entalpie/entropie fyz. a chem. procesů, chemický potenciál), termodynamická rovnováha v chemických systémech (fázové diagramy), rovnovážná konstanta chemické reakce, její nezávislost na tlaku a závislost na teplotě (van't Hoffova rovnice a graf), určování stechiometrie reakce (Job's plot)
- Rychlostní konstanta chemické reakce (transition-state theory, Kramersova teorie), rychlost difúzně limitovaných reakci (Smoluchowskeho model), reakce v plynech
- Chemická kinetika
- Termodynamický popis vícesložkových a vícefázových systémů
- Koligativní vlastnosti
- Povrchové jevy, nukleace.
Předmět rozvíjí partie statistické termodynamiky, které jsou důležité při experimentálním studiu makromolekulárních systémů.