Sylabus
1. Pocitacova fyzika - velke projekty soucasnosti: http://www.worldcommunitygrid.org/ http://www.jamstec.go.jp/esc/index.en.html http://www.illustris-project.org/
2. Simulace mnohočásticových systémů - metoda molekulární dynamiky.
3. Simulace proudění tekutin - numerické řešení Navier-Stokesových rovnic.
4. Metoda Monte Carlo.
5. Algoritmus pro fyzikálně korektní fotorealistické vykreslení 3D scény.
6. Vývoj hardwarových prostředků pro náročné numerické výpočty (www.top500.org)
7. Superpočítačové MetaCentrum (https://metavo.metacentrum.cz/) - přihlášení, dostupné softwarové balíky, spouštění úloh.
8. OpenMP - jak lze prostřednictvím 2-3 řádků vsunutých do programu 80x urychlit numerický výpočet na výpočetním uzlu klastru Zewura.
9. MPI - jak přimět počítače na opačných koncích republiky provést výpočet společně.
10. CUDA - demonstrace enormního výpočetního výkonu poskytovaného současnými grafickýcmi kartami.
11. Molekulárně dynamické simulace biomolekul.
12. Jak počítač vymýšlí strukturu potenciálního léku (http://autogrow.ucsd.edu/).
13. "Alchymistické" výpočty volné energie vazby potenciálního léku k cílové biomolekule.
Anotace
Seznámení se základy počítačové fyziky. Vhodné pro posluchače 2.r. oboru fyzika.