Kurz je zaměřen na praktické seznámení s biotou lotického i lentického sladkovodního prostřed í. Studenti si osvojí základní dovednosti ve sběru hlavních ekologických skupin vodních organismů ve stojaté a tekoucí vodě (forma exkurze; determinace v terénu i laboratoři), dále se seznámí se způsobem uchování živých úlovků, s rozbory vzorků a determinací hlavních taxonů s použitím základních určovacích znaků.
Teoretická část kurzu poskytne základní znalosti o sinicích, řasách, vodních rostlinách i živočiších a jejich biologii a významu pro vodní biotopy. Prakticky budou prezentováni zástupci bentosu, planktonu, nektonu, pleustonu a neustonu.
Na konkrétních příkladech budou vysvětleny základní termíny (voda jako biotop, abiotické a biotické faktory, morfologie a podélná zonace toku, stratifikace vodních nádrží, saprobní systémy, bioindikace, eutrofizace, samočistící schopnosti vody, acidifikace, říční kontinuum). Studenti se dozvědí o možnosti využití vybraných druhů organismů pro pozorování a chov ve sladkovodním akváriu.
Zmíněno bude i ohrožení a možnosti ochrany sladkovodních ekosystémů a také vliv vodohospodářských úprav a dalších antropogenních vlivů na sladkovodní biotu.