Anotace
V tomto předmětu se zaměříme na obecné principy vědecké práce, zejména formování a ověřování hypotéz a plánování výzkumu; výběr metod; přístupy ke sběru dat, jejich ukládání a anotaci; využívání vědeckých/biologických databází.
Hlavní náplní praktických seminářů bude biostatistika - tedy aplikace statistických přístupů na biologická data. Za účelem rozvoje další vědecké činnosti studentů, obzvláště se zaměřením na vyprácování závěrečných prací, si představíme hlavní zásady statistického zpracování biologických dat. A to od přípravy a čištění dat, přes využití popisných statistik (průměr, medián, percentily, kvartily, rozptyl, směrodatná odchylka), rozložení dat (spojité, diskrétní, Gaussovo/normální), úvod do pravděpodonosti (zákony pravděpodobnosti, čtyřpolní tabulka, prevalence a incidence, představení Bayesiánské statistiky) až k základním parametrickým a neparametrickým testům (varianty t-testů a jejich neparametrické analogy, χ2 test), korelacím a regresní analýze (korelační koeficient, Pearsonova a Spearmanova korelace, lineární regrese). Prostor bude věnovám i správné vizualizaci dat (bodové a spojnicové grafy, boxploty, 2D a 3D grafy, stromové grafy, biologické sítě, znázornění vícerozměrných dat), a také statistickým nástrojům - zejména využití volně přístupného prostředí programovacích jazyků R a Python.