1. systémová teorie a její aplikace na environmentální problémy, definice systému, prvky, vztahy mezi prvky a systémy.
2. úrovně analýzy a jejich použití pro zachycení procesů v biosféře, prostředí biosférických systémů, vnější prostředí, vnitřní prostředí.
3. ohraničení systémů v živé přírodě, udržování hranic, propustnost pro vstupy a výstupy.
4. komplexita v biosféře, lineární a komplexní systém, emergence, organizovaná a dezorganizovaná komplexita u živých systémů, gradient komplexity.
5. ekologický a evoluční čas, temporalita v přírodě, proměnlivost, geneze událostí a průběh procesů v biosféře, sebesimplifikace systému.
6. zanikání a reprodukce v biosféře, změny stavů, dynamická stabilita ekosystémů a populací.
7. biosférické struktury, náhodná uspořádání, vazebnost událostí v biosféře, latentní struktura, latentní funkce.
8. procesy v biosféře, struktury a čas, jednorázové události, typologie procesů a událostí - homogenní, heterogenní a neutrogenní vnitřní dynamika.
9. teoretická biologie a autopoietické systémy, sebereference, sebeorganizace, sebereferenční systémy, situace black box, vnitřní redundance.
10. diferenciace systémů v biosféře, interní a externí diferenciace, autopoietická reprodukce, růst komplexity.
11. diferenciační schémata u systémů v živé přírodě, interní diferenciace, externí diferenciace, systémové variace, variace vstupů, variace výstupů. Literatura: Luhmann N. Sociální systémy. 2006 Jeník J. Ekosystémy: Úvod do organizace zonálních a azonálních biomů. 1998, Karolinum Slavíková J. Ekologie rostlin. 1986, SPN: Praha
Aplikace obecné teorie systémů v oblasti ekologie a sociologie má velký význam pro komplexní, dynamické pochopení globálních procesů a umožňuje také zachytit variabilitu efektů a specifické podmínky rozdílných biotopů, včetně variability interakcí lokálních lidských populací a konkrétních ohrožených druhů. Koncepce kurzu je založena na komplexním analytickém myšlení, studenti si osvojí nový analytický rámec, který napomůže jejich efektivnější orientaci v environmentálním výzkumu a biosférických procesech.