Absolvent oboru má pokročilé znalosti organické chemie včetně metod moderní organické syntézy, stereochemie, a mechanismů organických reakcí. Rovněž disponuje teoretickými i praktickými znalostmi v oblasti identifikace struktury organických sloučenin instrumentálními metodami, v oblasti separačních metod a obecně analýzy organických sloučenin.

Nedílnou součástí jsou i praktické laboratorní dovednosti a orientace ve světové odborné literatuře a databázích týkajících se oboru. Kompetence jsou především v syntetických a analytických metodách spojených s výzkumem v oboru organické chemie.