Absolvent studijního programu Farmakologie a toxikologie je odborníkem v oblasti teoretické, experimentální i aplikované farmakologie a toxikologie. Výstupní odborné znalosti a zkušenosti se u absolventů liší v závislosti na individuálním studijním plánu a jejich specializaci během doktorského studia.

Obhajobou disertační práce absolvent dokládá, že je schopen samostatně vědecky uvažovat, pracovat a publikovat výsledky vlastní vědecké práce v odborných časopisech. Absolvent obdrží titul Ph.D. a splňuje předpoklady pro další kariérní růst v oborech, které se zabývají léčivy a jejich terapeutickými i toxickými účinky.

Absolventi mohou najít uplatnění v laboratořích farmaceutického průmyslu (např. preklinický/klinický výzkum a vývoj), v nemocnicích (např. laboratoře molekulární genetiky) nebo v akademickém/univerzitním prostředí.