Profil absolventa je do značné míry dán specifickými cíli jeho doktorské práce určující charakter přípravy pro vědeckou práci nebo praxi v oboru. Absolvent má odborné znalosti o parazitárních organismech (prvoci, helminti a členovci), zejména o molekulární biologii, imunologii, biochemii, patogenitě a epidemiologii, to vše s důrazem na interakce s hostitelem.

Je schopen řešit teoretické i praktické problémy související s parazity na multidisciplinární úrovni a prezentovat dosažené výsledky v mezinárodních časopisech a na vědeckých setkáních. Je schopen zapojovat se do projektů základního i aplikovaného výzkumu na vysokých školách a výzkumných ústavech.

Je připraven k práci ve školství, zdravotnictví, veterinární medicíně, ve státní správě i v soukromých farmaceutických, biotechnologických aj. firmách v ČR i zahraničí.