Absolvent shromáždil vědomosti v oboru lékařské mikrobiologie, molekulární epidemiologie, moderní mikrobiologické diagnostiky a antimikrobiální farmakoterapie. Osvojil si vybrané diagnostické postupy, technologie a metody, jejich aplikaci je schopen kriticky posoudit.

Znalosti aplikuje při experimentální práci v mikrobiologické laboratoři nebo při studiích zaměřených na analýzu antimikrobiálních účinků nových látek a molekulární analýzu rezistencí. Zvládá metody fenotypové a genotypové detekce mikrobů, včetně analýzy mikrobiálního genomu.

Je schopen vypracovat rešerši, navrhnout výzkumný projekt, prezentovat výsledky, naplánovat, sepsat a obhájit původní vědeckou práci. Je schopen samostatně navrhovat a řešit výzkumné úkoly, včetně řízení malých týmů, a propojovat mikrobiologii s příbuznými obory.

Zvládá komunikaci v anglickém jazyce.