Absolvent/ka doktorského studijního programu Aplikovaná fyzika a matematika v lékařství a farmacii je připraven/a pro samostatnou nebo týmovou výzkumnou činnost v širokém spektru vědních oborů napojených na lékařskou biofyziku, biofyziku ve farmaceutických vědách, matematickou biologii pro medicínu a farmacii, in silico modelování, biostatistiku a na bioinformatiku. K řešení fyzikálních nebo matematických problémů v oblasti lékařství a farmacie umí vystavět hypotézu, navrhnout výzkumný projekt, s využitím aktuálních biomedicínských a statistických metod hypotézu ověřit a výsledky vědecké práce prezentovat před odbornou komunitou.

Je schopen/a dále zvyšovat svou odbornou kvalifikaci. Praktikuje principy otevřené a reprodukovatelné vědy a ctí zásady etické vědecké integrity.