Absolvent má ucelené znalosti experimentální biologie rostlin, zakotvené v širších souvislostech biologických oborů. Absolvent specializace Ekofyziologie rostlin je především zaměřen na studium struktury a životních procesů rostlinných orgánů i celých rostlin s ohledem na jejich vztah k okolnímu prostředí a reakce na vnější faktory abiotické či biotické. Ovládá moderní, především specializačně zaměřené experimentální metody a osvojil si jejich principy.

Absolvent dokáže analyzovat a řešit vědecké problémy, správně interpretovat a prezentovat výsledky. Uplatní se v základním i aplikovaném výzkumu v biologických oborech, zejména rostlinně orientovaných, ve vědeckých, akademických i komerčních institucích doma i v zahraničí.