Absolvent má znalosti z experimentálních metod biofyziky a chemické fyziky, zejména optických a dalších spektroskopických metod, strukturní analýzy a zobrazovacích technik, vedle toho i z kvantové teorie a statistické fyziky molekul a molekulárních systémů. Výběrem povinně volitelných předmětů a diplomové práce se absolventům dosáhne hlubšího vzdělání v oblasti biochemie a molekulární biologie, biofyziky fotosyntézy či strukturních metod.

Prostřednictvím pravidelných seminářů získají studenti představu o současných problémech řešených v jednotlivých oborech a o metodách vědecké práce. Nabyté vzdělání nabízí absolventům uplatnění i v mezioborových týmech zabývajících se fyzikou, biologií, chemií, medicínou, materiálovým výzkumem, bio- a nano-technologiemi či farmacií.