Vztah mezi DNA lidského papilomaviru (HPV) a orofaryngeálním dlaždicobuněčným karcinomem je prokazován řadou studií, které implikují HPV infekci jakožto rizikový faktor pro vznik tohoto nádoru. Naproti tomu dlaždicobuněčné karcinomy ústní sliznice nejsou s DNA lidského papilomaviru asociovány.
Ve studii byla použita kvantitativní PCR metoda pro srovnání exprese genů, které mohou sloužit jako indikátory trvalé stimulace nádorových buněk virovými antigeny jak u orálních tak u orofaryngeálních dladicobuněčných karcinomů. Výsledky ukazují, že HPV-pozitivní orofaryngeální nádory vykazovaly genovou expresi ukazující na virovou příčinu, přičemž HPV-negativní orofaryngeální nádory a orální nádory žádnou virem indukovanou genovou expresi nevykazovaly.