Charles Explorer logo
🇨🇿

Prostorová distribuce v oocytech Xenopus laevis měřena pomocí qPCR tomografie

Publikace na Přírodovědecká fakulta |
2010

Abstrakt

Vysoko-rozlišovací kvantitativní PCR tomografie je zcela nová metoda, která slouží k určení lokalizace RNA v biologických vzorcích, popřípadě i v jednotlivé buňce. Oocyty žab Xenopus laevis byly na kryostatu nařezány podél animálně-vegetální osy na 30µm řezy.

Následovala izolace celkové RNA a její přepis do cDNA. Ke kvantifikaci 33 genů byla použita mikrofluidní qPCR platforma BiomarkTM (Fluidigm), kde na dynamickém čipu 48x48 lze kvantifikovat více než 2300 vzorků v jednom kroku.

Výsledkem je obraz prostorového rozložení maternálně uložené mRNA podél animálně-vegetální osy v oocytu Xenopus laevis.