Charles Explorer logo
🇨🇿

Funkční analýza isoforem mangan-stabilizujícího proteinu

Publikace na Přírodovědecká fakulta |
2010

Abstrakt

Fylogenetická analýza sekvencí MSP ukázala, že většina krytosemenných rostlin má dva geny pro MSP a tedy i dvě izoformy MSP, lišící se vždy přibližně 10 aminokyselinami. To naznačuje u krytosemenných rostlin evolučně původní dvě izoformy.

Proč jsou si však paralogní izoformy jedné rostliny sekvenčně podobnější než ortologní izoformy mezi druhy? Evoluci a diverzifikaci MSP zjevně něco brání, pravděpodobně nějaký interaktor. Pomocí mapování rozdílů mezi ortology na model struktury MSP jsme se pokusili identifikovat potenciálního hlavního interaktora, pomocí mapování rozdílů mezi paralogy jsme se pokusili objasnit rozdíly mezi funkcí dvou izoforem.

Případnou roli MSP v rychlé regulaci fotosyntézy, zajišťovanou vazbou různých izoforem za různých podmínek, jsme analyzovali pomocí 2D Blue Native-SDS PAGE a hmotnostní spektrometrie.