Molekulární simulace pro řešení struktur se na KCHFO MFF UK etablovali v roce 1997 zakoupením software Cerius a počítače od SGI Octane. Programové vybavení bylo rozšířeno o Marerial Studio firmy Accelrys pro PC.
Obojí software je používán pro strukturní analýzu struktur od silikátů, hydrotalcitů po tekuté krystaly, kakaové prášky a léky. Software je rovněž intenzivně využíván pro výuku studentů a strukturní analýza metodami molekulárních simulací byla použita při zpracování jejich diplomových a disertačních prací.
Vyřešení struktury anorganicko organických hybridních práškových materiálů bez simulací je velmi obtížné až nereálné.