Minoritní strukturní proteiny jsou esenciální pro virovou infekci, ale jejich funkce v replikačním cyklu polyomaviru nejsou celkem jasné. Důležitou úlohu mají tři hydrofobní domény pro VP2 a dvě domény pro VP3.
Byly připraveny plasmidy pro expresi EGFP fúzních variant VP2 a VP3 a jejich deleční mutanty (s individuální delecií hydrofobních domén). Studovali jsme jejich cytotoxicitu, lokalizaci a afinitu k intracelulárním membránám.
Minoritní proteiny fúzované s EGFP na jejich C-konci vykazovaly podobné vlastnosti jako nefúzované verze. Indukují apoptózu 3T3 buněk závislou na kaspázové aktivaci.
I přes nukleární lokalizační signál vykazovala větší subpopulace VP2-EGFP a VP3-EGFP lokalizaci v cytoplasmě, kolokalizující s intracelulárními membránami. Studium delečních mutant odhalilo důležitost hydrofobní domény 2 pro afinitu k buněčným membránám.