Řeka Vltava hraje významnou roli v charakteru české přírody jakožto migrační cesta, centrum biodiverzity, refugium ohrožených společenstev atd. Přestože tvář středního Povltaví silně poznamenaly výstavby přehradních nádrží, území je cennou ukázkou tzv. říčního fenoménu.
Střední tok je na rozdíl od dolního Povltaví méně prozkoumanou oblastí, která přináší řadu zajímavých objevů.