V graviditě je problematika vaginálního ekosystému zmiňována zejména ve vztahu k předčasnému porodu a dále k rozvoji infekčních komplikací, které mohou mít i dnes ty nejzávažnější následky. Včasná diagnostika a cílená léčba subklinických infekcí bude cestou v prevenci a léčbě předčasného porodu.