Abstrakt
Provedli jsme sekvenaci a analýzu genomu izolátu z asambláže E z důvodu pochopení genetické rozdílnosti v rámci druhu Giardia intestinalis. Identifikovali jsme 5012 genů kódujících proteiny, z nichž většina je konzervovaná ve smyslu mikrosyntenie a sekvenční identity.
Ale na všech chromosomech byl prokázán nečekaně vysoký počet změn v jejich uspořádání a několik menších strukturálních změn. Byli identifikováni noví členové rodin VSP, NEK kináz a HCMP, což může přispět k odhalení možných mechanismů hostitelské specificity a odkrýt nové cesty antigenní variability.
Extenzivní analýza polymorfismu v základním proteomu giardie odhalila odlišnou rychlost diferenciace buněčných procesů. Naše výsledky naznačují,že přes dobře konzervované základní geny existuje mezi izoláty giardií významná variabilita genomu jak ve smyslu obsahu genů, tak polymorfismu genů, strukturní variability chromosomů a repertoáru povrchových molekul.