Delece konzervované nekódující sekvence v intronu genu Plzf vede k snížení exprese Plzf v končetinových pupenech a k polydaktylii u potkana
Abstrakt
Mutace Lx se u potkana kmene SHR.Lx projevuje jako preaxiální polydaktylie zadních končetin. Lx bylo již dříve lokalizováno na chromozom 8, do úseku obsahujícího gen Plzf.
Nicméně kódující sekvence tohoto genu (jehož úloha ve vývoji končetin je částečně známa) je u mutantů intaktní. Pomocí genetického mapování na F2 hybridech jsme omezili segment obsahující Lx na 155 kb.
V tomto úseku jsem sekvenovali konzervované nekódující sekvence (CNE). Delece 2964 bp v intronu 2 genu Plzf, která se nevyskytuje u žádného kontrolního kmene, je jedinou změnou, která může být podkladem Lx.
Tato delece postihuje nejvíce konzervovaný CNE z celého segmentu (155 kb) a může způsobovat poruchu regulace Plzf. Pomocí hybridizace in situ a kvantitativní PCR jsme nalezli snížení exprese Plzf, se současným rozšířením domény exprese jeho cílových genů, Hoxd10-Hoxd13, zatímco exprese genu Sonic hedgehog byla normální.
Nadřazená regulace exprese genu Plzf je v současnosti neznámá.