Mezinárodní projekt IBD AHEAD 2011, na kterém participovalo 36 zemí, byl zaměřen na získání konsenzu, jakým způsobem monitorovat aktivitu zánětu u pacientů s Crohnovou chorobou. Byly stanoveny čtyři klinické situace: vstupní vyšetření, monitorování symptomatického pacienta, monitorování asymptomatického pacienta a sledování nemocného po resekci střeva.
Mezinárodní konsenzus ukázal, že klinická symptomatologie je nedostačující pro přesné zhodnocení aktivity nemoci. K laboratornímu monitorování se vedle standardních ukazatelů (CRP) využívají fekální markery.
Ileokoloskopické vyšetření a magnetická rezonance jsou zlatými standardy zobrazovacích vyšetření. V pooperačním monitorování je zásadní koloskopické sledování.