Genitální trakt je chráněn především lokálně produkovanými a systémovými IgG protilátkami na rozdíl od trávícího systému s dominantní sekrecí IgA. lokální imunizace nebo infekce vyvolávají slabou imunitní odpověď. Stanovení HIV-specifických protilátek v séru a sekretech odhalilo selektivní chybění IgA odpovědi.