Slizniční imunoglobuliny zajišťují ochranu dvěma doplňujícími se mechanismy: jako specifické protilátky a dále vazbou imunoglobulinu přes glykan. Vazba bakteriálních ligandů s glykanem IgA představuje mechanismus nezávislý na specificitě protilátek a pracující především v trávícím traktu.
S-IgA tak spojuje mechanismy přirozené i adaptivní imunity v jedné molekule.