Charles Explorer logo
🇨🇿

Studie genomu klasického Hodgkinova lymfomu a skupin definovaných EB virem

Publikace na 1. lékařská fakulta |
2012

Abstrakt

Kumulativní důkaz naznačuje, že rizikové faktory pro klasický Hodgkinský lymfom (cHL) se liší nádorovým virem Epsteina- Barrové (EBV). Tato potenciální etiologická různorodost není rozpoznána v současné klasifikaci nemocí.Provedli jsme studii asociace genomu 1200 cHL pacientů a 6417 kontrolních subjektů, s ověřením v nezávislé replikační sérii, abychom identifikovali společné genetické varianty spojené se všemi cHL a podtypy definované nádorovým EBV.

Mnohočetná logistická regrese byla použita pro výpočet ORs a 95 % intervalu spolehlivosti s předpokládaným log-additive genetickým modelem pro varianty. Všechny statistické testy byly dvoustranné.

Byly identifikovány dva nové lokusi spojené s celkovým cHL bez ohledu na EBV v hlavním histokompatibilním komplexu; jeden je umístěn vedle MICB a druhý na HLA-DRA, oba výsledky byly potvrzeny nezávislou replikací. V souladu s předchozími výsledky, asociace byly nalezeny mezi EBV pozitivní cHL a genetickými variantami v oblasti třídy I a mezi EBV-negativní cHL a rs6903608 v oblasti třídy II.

Asociace mezi rs6903608 a EBV-negativním cHL byla omezena na histologický subtyp nodulární sklerózy. Byl nalezen průkaz pro asociaci mezi EBV-negativní cHL a rs20541 (5q31, IL13: OR = 1.53, 95 % CI = 1,32 - 1,76, P = 5,4 x 10(-9)), variantou dříve spojenou s lupénkou a astmatem; nicméně pro replikaci byly důkazy méně průkazné.

Zejména jedna další varianta související s psoriázou, rs27524 (5q15, ERAP1), prokázal souvislost s cHL v genomové studii (OR = 1.21, 95 % CI = 1,10 na 1,33, P = 1,5 x 10(-4)) a replikační serii (P =.03). Celkově tyto výsledky poskytují přesvědčivé důkazy, že EBV je etiologicky důležitý pro klasifikaci cHL a také naznačují, že některé komponenty patologických procesů jsou společné pro EBV-pozitivní a negativní EBV pacienty.