Syndrom neklidných nohou je významně spojen s roztroušenou sklerózou (RS), a to zejména u pacientů s těžším zdravotním postižením. MS by měla být uvažována při sekundárních formách RLS.
Idiopatické formy RLS nesdílejí všechny hlavní genetické znaky se sekundární formou RLS u pacientů s RS.