Nová rodina aktivních endogenních retrovirů přispívá k variabilitě genomu u inbredních kmenů potkana
Abstrakt
Endogenní retroviry (ERV) způsobují u savců řadu mutací. Nicméně autonomní retrotranspozice ERV nebyla u potkana dosud prokázána.
Izolovali jsme ERV, který způsobil mutaci v genu pro centrobin a identifikovali jej jako člena nové rodiny retrovirů (RnERV-K8e). Tato rodina je blízce příbuzná nedávno zjištěným ERV u myši (MmERV-K10c).
U myši jsme také nalezli nový ERV, neočekávaně podobný RnERV-K8e, což svědčí pro možný mezidruhový přenos. Klonovali jsme potenciálně aktivní ERV z rodiny RnERV-K8e a prokázali jsme, že je schopen retrotranspozice.
Tento element kóduje obalový protein (env), ale tento není pro retrotranspozici nezbytný. U inbredních kmenů potkana jsme nalezli velké množství polymorfních lokusů spojených s RnERV-K8e, což svědčí pro pokračující retrotranspoziční aktivitu a výrazně přispívá ke genetické variabilitě mezi různými inbredními kmeny.