Kryptosporidióza je vyvolána intracelulárními střevními prvoky rodu Cryptosporidium ze skupiny Apicomplexa. U člověka se nejčastěji vyskytují C. parvum a C. hominis.
Způsobují průjmová onemocnění, která jsou zvláště závažná u imunokompromitovaných osob, především pacientů s AIDS. Dalšími protozoárními původci průjmových onemocnění člověka jsou Isospora belli, Cyclospora cayetanensis, Balantidium coli a Dientamoeba fragilis.