Charles Explorer logo
🇨🇿

Využití jednokapilárového obousměrného sekvenování pro genotypizaci TGFβ1 genu

Publikace na Lékařská fakulta v Hradci Králové |
2013

Abstrakt

Ve studii prezentujeme metodu jednokapilárové elektroforézy při verifikaci obousměrné sekvenační analýzy pro genetický polymorfismus -1552delAGG v genu TGFB1. Pro verifikaci byla použita sekvenační reakce s forward a reverzními primery modifikovanými na 5´- koncích adaptery složenými z 55 (forvard primer) a 10 (reverzní primer) repeticemi cytosinu a adeninu (CA adaptéry).

Ty umožnily kompletní čtení obou vláken amplikonu a definovat rozdílný migrační čas obou fragmentů při kapilární elektroforéze. Studie ukázala, že připojení CA adaptérů k primerům umožňuje provést sekvenování obou vláken amplikonu v jedné reakční zkumavce a separovat obě vlákna v jediné kapiláře.