Vakcinace je velmi účinný nástroj preventivní medicíny. Díky vakcinaci se výrazně snížila nemocnost i úmrtnost na řadu závažných infekčních onemocnění.
Ačkoli je obvykle bezpečná a má málo nežádoucích účinků, u predisponovaných jedinců může indukovat rozvoj autoimunitních onemocnění. V článku jsou uvedeny mechanizmy indukce autoimunity a možná spojitost s vakcinací.