Vyšetření tenkého střeva endoskopem bylo dlouho mimo dosah našich přístrojů. Push enteroskopie dosahovala jen orální části jejuna, intraoperační enteroskopie znamenala pro pacienta operační zátěž.
Přelom tisíciletí, konkrétně rok 2001, je mezníkem v endoskopii tenkého střeva. Objevuje se dvojbalonová enteroskopie a kapslová enteroskopie.
Obě metody umožňují kompletní vyšetření tenkého střeva. Postupně je snaha rozvíjet další metody (jednobalonová enteroskopie, spirální enteroskopie a další modifikace) a vžívá se název "hluboká enteroskopie" - tedy deep enteroscopy.
Deep enteroscopy, v podobě dvojbalonové, jednobalonové či spirální enteroskopie, umožňuje vyšetření tenkého střeva, odběry bioptických vzorků a endoskopickou léčbu optimálně v celém tenkém střevě. Společně s kapslovou enteroskopií tvoří zlatý standard pro vyšetření tenkého střeva.