Bipolární afektivní porucha je doprovázena poruchou poznávacích funkcí přetrvávající i mezi jednotlivými fázemi nemoci. Kognitivní porucha má zřejmě genetický podklad a je jen částečně ovlivňována medikací a průběhovými charakteristikami nemoci.
Kognitivní porucha je významně spojena s narušením funkčních schopností pacientù a možnost jejich zlepšení terapeutickými intervencemi je aktuálně zkoumána.