V této práci jsme porovnali metody sloužící pro charakterizaci protein – proteinových interakcí jako jsou gelová filtrace, modrá nativní elektroforéza, separace proteinů pomocí sacharózového gradientu a konfokální mikroskopii. Diskutovány jsou výhody a nevýhody těchto metod vzhledem k výzkumu proteinových interakcí hlavního kapsidového proteinu VP1 a morfogeneze virionu myšího polyomaviru.