Vysvětlení reakčního mechanismu glutamát karboxypeptidasy II pomocí mutageneze, rentgenové strukturní analýzy a metod výpočetní chemie

Abstrakt

Byla studována hydrolýza peptidu enzymem GCPII. Nejprve byla provedena analýza enzymové kinetiky GCPII za použití N-Ac-Asp-Glu jako substrátu.

Dále byla vyřešena krystalová struktura GCPII v komplexu s N-Ac-Asp-Glu při rozlišení 1.70 A. Experimentální data byly doplněny výpočty (metodou QM/MM), které pak poskytly detailní informace o reakčním mechanismu GCPII.

Klíčová slova

• reakční mechanismus
• výpočty QM/MM
• glutamát karboxypeptidasa II
• rentgenová strukturní analýza
• mutageneze